名侦探柯南与黑衣组织有关的集数有（不完全统计）：001《云霄飞车杀人案件》
002《董事长千金诱拐事件》
005《 新干线大爆破事件》
013《奇怪的寻亲杀人事件》
043《江户川柯南诱拐事件》
048——049《外交官杀人事件》
054 《游戏公司杀人事件《》
118 《浪花连续杀人事件《》
128《黑暗组织10亿抢劫事件》
129《来自黑暗组织的女子大学教授杀人事件》
176到178《与黑暗组织的再会》
190到193《危命的复活》
230 到231《谜一样的乘客》
286到288《工藤新一纽约事件》
309到311《与黑暗组织的接触》
462到465《黑暗组织的影子》
580《紧迫黑色的时限》
671 到674《侦探们的夜想曲》
699到700《逼近灰原秘密的黑影》
701到704《漆黑的特快列车》
703到704《漆黑的特快列车》
