鸭场消毒包括杀灭病原微生物（如细菌、病毒、霉菌等）和消灭体内外寄生虫（如原虫、蠕虫、节肢动物等）。消毒范围包括鸭舍、运动场、孵化室、育雏室、料槽和水槽、饲养工具等；病鸭通过的道路和停留过的场舍，如饲养棚舍、隔离舍、通道等病鸭污染的一切场所；病鸭的排泄物（粪尿）及尸体等；鸭场周围环境、道路、交通运输工具；工作人员的衣帽、手套、胶靴等。鸭场常用消毒药物包括：
（1）漂白粉 漂白粉对细菌、芽孢、病毒等均有效，但不持久。漂白粉干粉用于地面和病鸭排泄物的消毒，其水溶液用于圈舍、饲槽、车辆、饮水、污水等消毒。饮水消毒用0.03%～0.15%，喷洒、喷雾用5%～10%乳液，也可以用干粉撒布。
（2）来苏儿（煤酚皂溶液、甲酚皂） 来苏儿对细菌繁殖体、真菌、亲脂性病毒有一定杀灭作用，用于器械、鸭舍消毒及污染物的处理。1%～2%用于皮肤、手指消毒，5%～10%用于器械、鸭舍消毒及污染物的处理。
（3）农福 农福具有抗菌抗病毒作用，80～100倍稀释用于消毒鸭舍、料槽，60倍稀释用于浸泡洗涤器械。该消毒剂以单独使用为宜，若与碱性药物混合使用则降低其消毒效果。
（4）过氧乙酸 0.04%～0.2%浓度用于饲养用具及人员手臂消毒；0.5%浓度用于对室内空气、墙壁、地面和笼具等表面消毒；0.3%浓度用于带鸭气雾消毒，用量为每立方米30毫升；鸭舍封闭时，可用5%浓度喷雾消毒，每立方米空间用2.5毫升。
（5）二溴海因 二溴海因具有强烈杀灭真菌、细菌、病毒和芽孢的效果。一般消毒，250～500毫克/升，作用10～30分钟；特殊污染消毒，500～1000毫克/升，作用20～30分钟；诊疗器械用1000毫克/升，作用1小时；饮水消毒，根据水质情况，加溴量2～10毫克/升；用具消毒，500毫克/升，浸泡15～30分钟；空气消毒，用1000毫克/升，喷雾或超声雾化10分钟，作用15分钟。
（6）高锰酸钾 高锰酸钾可杀灭细菌繁殖体、真菌、细菌芽孢和部分病毒。主要用于皮肤黏膜消毒，100～200毫克/升；物体表面消毒，1000～2000毫克/升；饲料饮水消毒，50～100毫克/升；浸洗种蛋和环境消毒，浓度5000毫克/升。
（7）环氧乙烷 环氧乙烷常用于皮毛、塑料、医疗器械、用具、包装材料、鸭舍、仓库等的消毒或灭菌，而且对大多数物品无损害。杀灭细菌繁殖体，每立方米空间用300～400克作用8小时；杀灭污染霉菌，每立方米空间用700～950克作用8～16小时；杀灭细菌芽孢，每立方米空间用800～1700克作用16～24小时。环氧乙烷气体消毒时，最适宜的相对湿度是30%～50%，温度以40～54℃为宜，不应低于18℃，消毒时间越长，消毒效果越好，一般为8～24小时。
（8）百毒杀 百毒杀为双链季铵盐类消毒剂，饮水消毒，预防量按有效药量10000～20000倍稀释；疫病发生时可按5000～10000倍稀释。鸭舍及环境、用具消毒，预防消毒按3000倍稀释，疫病发生时按1000倍稀释；鸭体喷雾消毒、种蛋消毒可按3000倍稀释；孵化室及设备可按2000～3000倍稀释喷雾消毒。
（9）烧碱 烧碱为碱性消毒剂的代表产品。浓度为1%时主要用于玻璃器皿的消毒，2%～5%时，主要用于环境、污物、粪便等的消毒。本品具有较强的腐蚀性，消毒时应注意防护，消毒12小时后用水冲洗干净。
（10）生石灰（氧化钙） 生石灰加水后产热并形成氢氧化钙，呈强碱性。常用20%石灰乳溶液进行环境、圈舍、地面、垫料、粪便及污水沟等的消毒。生石灰应干燥保存，以免潮解失效。石灰乳应现用现配，最好当天用完。
（11）福尔马林 应用福尔马林熏蒸消毒鸭舍，按每立方米空间用福尔马林25毫升、水12.5毫升、高锰酸钾25克进行。消毒过程中应保持鸭舍密闭，经12～24小时后打开门窗通风换气。当急需使用鸭舍时，可用氨气来中和甲醛气体。消毒时应将鸭舍内用具、饲槽、水槽、垫料等物品适当摆开，以利气体穿透。
